以下是一些女主很聪明且属于悬疑类的日本漫画推荐：
《推理之绊》该作品是日本侦探悬疑类漫画的经典之作。故事围绕月臣学院学生鸣海步展开，他虽作风懒散，但头脑聪明。其兄长鸣海清隆被称为“拥有神的头脑”，却在两年前神秘失踪。为查明兄长失踪之谜，鸣海步开始了一系列调查。在此过程中，神秘的杀人事件接连在他身边发生，这些案件的疑点都似有若无地指向“诅咒之子”以及其背后隐藏的神秘真相。女主虽未在简介中着重突出，但在整个推理过程中，与鸣海步相关的女性角色也展现出了一定的智慧和推理能力，共同推动着剧情的发展，为解开谜团贡献力量。
《非正常死亡》这是由绪川あお创作的青年悬疑漫画。女主表面上是一个活泼开朗的JK（女高中生），看似与普通少女无异，但实际上她拥有独特的能力。一旦有人非正常死亡，女主就像拥有雷达一般能够敏锐地感受到，并且可以较为精准地找到案发现场。她不仅具备这种特殊的能力，还拥有极强的心理素质，在面对各种血腥、恐怖的案发现场时，能够保持冷静，凭借自己的智慧负责破解案情。在破案过程中，她与富二代刑警男主相互合作，男主利用自己的身份和资源为调查提供便利，女主则凭借自己的能力找到关键线索，两人携手揭开一个个非正常死亡背后的真相。这部漫画将女主的聪明才智与悬疑的剧情紧密结合，为读者呈现了一个充满惊险与刺激的推理世界。
