阿笠博士是坏人这一点已经被原作者否定了。 至于毛利小五郎，他很可能实力十分强大只是没有表现出来，理由如下： 1、小五郎身手不凡，柔道十分厉害 2、在M9水平线上的阴谋中，他比柯南更早发现真凶 3、在M5通往天国的倒计时中，有一台可以预见10后模样的机器，小五郎硬拉柯南试，说明他很有可能已经猜到了柯南的真实身份 4、一个人不可能被麻醉破案多次而不发觉，所以有可能是他在刻意为柯南掩饰 5、像妃英理这样的人绝不可能喜欢并嫁给一个白痴一样的人 6、第十四个目标中讲到了妃英理离开小五郎的原因，未免太过牵强，更有可能是毛利与黑衣组织周旋不希望波及到爱人 7、毛利小五郎的名字是由亚瑟罗宾的作者卢布朗和江户川乱步塑造的明智小五郎得来的，由此看来，毛利在青山心目里应该是个优秀的侦探 8、小五郎约会杀人事件毛利干脆自己假装睡掉，而之前和他一起的只有柯南一人，显然意识到了柯南在做什么 9、只要只有柯南和小五郎两个人时，小五郎对柯南的态度就大转变，像是一起破案的伙伴。而每次柯南如果很认真地来和小五郎说他发现了什么，小五郎都会相信 10、TV038当中大叔曾经说过，每当我推理遇到瓶颈的时候，这个小子的一句话（当然是指柯南）总是给我很大的启示。这家伙绝对不是等闲之辈，他到底是什么来头？ 11、在M10侦探们的镇魂歌中，在委托人提到特殊ID的危险性后，柯南脱口而出：“兰”，虽然声音不大，但小五郎马上问道“那兰她们的呢？”很明显，他听到了柯南的话。另外，在随后柯南联系灰原之后，小五郎问“兰呢？”，柯南只是摇了摇头，可见作为侦探的默契.（最重要的不是这一点，想想看，假设你是毛利，你家养的小孩突然管你闺女叫兰你不会觉得奇怪吗，还和他头头是道地谈起来？更奇怪的是这个小孩居然没有发现他自己喊了一声“兰”！）12、很多集，大叔被打针后都会说一些话，比如：“啊！我要开始了！”或者“啊！沉睡的小五郎出现了！”还有如“你还真狠心呢！好歹让我先喝一口吧！”又或者是“又来了，怎么这么突然呢！好歹先打声招呼啊！”所以，推理大叔极有可能知道他被麻醉甚至知道被柯南君麻醉，而且只要旁边有椅子，就一定会坐在椅子上，应该是故意的。 13、 TV609中柯南用小五郎的声音(没被打针前）后他的种种表现……大叔想到，“从另一个地方传来我的声音之后，我的脖子就会像针扎了一样”（也算经常这样吧= =;)毛利大叔也应该发现这是柯南做的了吧。（都这么多次了……= =） 14、毛利大叔对死者的亲属或关系很好的人想要不顾生命的行为拼命的阻止，而且从表情来看并不是一个糊涂的侦探该有的表情。 15、毛利大叔在柯南破案过程中给过很多表面上不以为然的提示。说起来柯南君破案基本上靠的是别人的提示找到了凶手（比如步美啊，光彦啊，元太啊，灰原什么的- -）。 16、在贝克街的亡灵里，灰原哀一副大人的样子，毛利小五郎就憋了口气，当灰原哀又装成小孩子，毛利大叔就舒了一口气，由此推断毛利小五郎应该是知道灰原的身份的，这样用大人口气说话很容易被发现，既然知道灰原的身份，那就应该知道柯南的真实身份~~ 17、毛利在m9中，推理凶手的过程中，出现了一些小误差。这时柯南赶到，用蝴蝶结变声器帮助了小五郎，毛利只是懵了一下，然后就继续跟凶手纠缠了。如果是普通人，就会东张西望的，而小五郎却不这么做，说明其很有可能知道了柯南身份。而且后面一起救小兰的时候，是那么心有灵犀。 18、在tv版184集中小五郎因为不能进入案发现场，让柯南从气窗进入，一般情况下，小五郎总是阻止柯南接近案发现场，但一旦到了这种关键时刻小五郎就不会阻止他引导破案。 19、在TV548柯南脱离了大岭的控制后，小五郎对柯南说：“我们要出发了，小孩子的时间结束了。”表明大叔知道柯南真实身份。注意：小五郎说完看柯南（工藤新一）的表情。虽然只是一瞬即逝。
