马鞍山市卫生局是马鞍山市人民政府工作部门，负责规划全市卫生资源配置，监督管理医疗机构及卫生人员，指导医疗卫生机构业务技术与改革。其主要职责包括实施卫生发展规划、传染病防治监督、突发公共卫生事件应急处置、新型农村合作医疗管理及中医药发展工作。2012年起该局在市属公立医院实施药品供应链信息化系统管理，通过批量采购、个性化配送等模式实现药品库存量下降22% 。2020年办理的室内公共场所禁烟行政处罚案例具有典型示范意义 。2023年联合多部门开展'综合查一次'联合检查，跨部门检查事项合并率达75% 。2024年启动花山区无结核社区建设试点，通过疾病预防控制体系推进结核病防治 。2025年协同医保局等部门发布三医协同发展和治理工作清单，涵盖政策衔接、信息联通等21项内容 。
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