三明市住房公积金管理中心成立于1994年，是三明市人民政府直属的不以盈利为目的的财政核拨事业单位（挂靠市财政局代管），对全市住房公积金实行统一管理、统一制度、统一核算。中心内设综合科、政策法规科、计划财务科等5个科室，下设市区管理部等11个管理部（如市区管理部位于三明市行政服务中心3楼），办公地址位于福建省三明市三元区碧湖行政服务中心三楼。中心领导为主任肖祖雄（2025年2月任命），主持全面工作。从业人员包括在编53人及非在编31人。
该中心主要承担住房公积金归集、使用计划编制与执行，负责缴存、提取、贷款审批发放回收及资金核算，实施保值增值并承办住房公积金管理委员会决策事项。基本支出1423.49万元，项目支出176.85万元；一般公共预算“三公”经费支出预算合计8.70万元。2025年重点工作及绩效目标包括推进灵活就业人员缴存、深化“放管服”改革、推进信息化建设，以及实现住房公积金归集额50亿元、贷款逾期率控制在0.4‰以内等。
通过推进灵活就业人员缴存、优化贷款政策（如2024年提高贷款额度、降低首付比例）、拓展“跨省通办”服务、深化信息化建设（如上线不动产信息共享查询功能）等措施，持续支持职工住房消费需求。2024年，全市实缴单位8158家，实缴职工25.40万人，缴存额51.80亿元；发放个人住房贷款0.57万笔21.43亿元。
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