玉树藏族自治州人民政府是玉树藏族自治州人民代表大会的执行机关，是青海省玉树藏族自治州的国家行政机关，对玉树藏族自治州人民代表大会和青海省人民政府负责并报告工作，在玉树藏族自治州人民代表大会闭幕期间，对玉树藏族自治州人民代表大会常务委员会负责并报告工作，每届任期五年，实行州长负责制。 玉树藏族自治州成立于1951年12月，是青海省第一个、全国第二个成立的少数民族自治州。 州境位于青、川、藏、疆四省区交汇地，是长江、黄河、澜沧江的发源地，总面积26.7万平方公里。现辖玉树市、称多、囊谦、杂多、治多、曲麻莱1市5县，总人口41.66万，其中藏族占总人口的98%。 现任州长为龙措（州委副书记、州长，州政府党组书记）。
自1951年建政以来，经历了从三江源自然保护区设立到三江源国家公园体制试点的生态保护进程。 近年来，有《玉树州国土空间总体规划(2021—2035年)》等规划工作。
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