《吴邪私家笔记》大结局主要包含西沙海底墓收尾、铁三角成长与羁绊以及悬念留白三方面内容。
在西沙海底墓收尾方面，吴邪为寻找失踪的三叔进入海底墓，在墓中与王胖子、张起灵重逢合体。他们揭露了蛇眉铜鱼的秘密，证实西沙海底墓是汪臧海进行长生实验的地方，而海猴子、禁婆等怪物则是当年试验的产物。
铁三角在经历此次探险后，都有了明显的成长与变化。吴邪从“天真”少年逐渐蜕变为能够做决策的人；张起灵展现出强大的战斗力，清理了海猴子、禁婆等危险生物；王胖子依旧是队伍中的幽默担当。三人之间的默契进一步加深。
结局还留下了悬念。故事停留在海底墓探险结束，并未涉及云顶天宫的剧情。三叔的下落依旧不明，汪家的阴谋也未完全揭露，这些后续伏笔呼应了该剧“填坑《盗墓笔记》未解之谜”的设定，给观众留下了想象空间。此外，该剧以吴邪第一视角展开，融合“现实 + 回忆 + 笔记”三重时空，还还原了原著的恐怖元素，动作戏也十分密集，被评价为“全程高能”。
