《庆余年》第三季的主要剧情围绕范闲的成长与决裂展开。
江南查账与权谋交锋：范闲前往江南，利用明家私生子夏栖飞，在与北齐、东夷城的金融战中，巧妙设局，激化明家内斗，最终使明家名存实亡，自己则彻底掌控了内库。同时，他还揭露了长公主与明家的勾结，进一步巩固了自己的地位。
胶州水师风云：在调查明家勾结海盗的过程中，范闲解决了水师提督常昆，并收服了母亲叶轻眉的旧部许茂才，进一步强化了自身的势力。
澹州探亲与情感纠葛：范闲探望祖母时，提及迎娶海棠朵朵却遭到家族的反对。祖母则主持让柳思思入妾，范闲承诺不会薄待正妻林婉儿，展现了他在家族和情感之间的纠葛。
大东山之战：庆帝祭天设局，暴露了大宗师实力，并重创了四顾剑和苦荷。叶流云反水，范闲在乱局中从“棋子”蜕变为“执棋者”，与燕小乙对决并将其击杀，从而奠定了自己在江湖中的地位。
京都叛乱与父子决裂：陈萍萍刺杀庆帝失败，惨遭凌迟处死。范闲当众揭发太子与长公主的乱伦关系，并毒杀太后为母报仇，与庆帝彻底撕破脸。庆帝假传死讯引发内乱，范闲则联合大皇子平定了叛乱。
神庙秘密与终极决战：范闲揭开了母亲叶轻眉的死因及神庙的真相，并联合范若若、五竹对抗庆帝。最终，庆帝因好奇揭开五竹的眼罩，被激光眼击杀（另一说法是真气炸体而亡），这场终极决战也宣告了范闲的胜利。
结局与归隐：庆帝死后，幼子李承平继位。范闲平定叛乱，收复东夷城，并携家人隐居西湖。虽然隐居，但他仍暗中掌控着内库与朝堂的影响力，成为了幕后的“无冕之王”。
